Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TNIKQ9UKE5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms