Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SIRT1Q96EB6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms