Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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HIF1AQ16665 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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HIF1AQ16665 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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HIF1AQ16665 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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HIF1AQ16665 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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HIF1AQ16665 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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HIF1AQ16665 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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HIF1AQ16665 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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HIF1AQ16665 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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