Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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