Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 REV1YOR346W 2958 nt2.51□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 KEL2YGR238C 2649 nt2.51□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 RRP12YPL012W 3687 nt2.5□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 SRO77YBL106C 3033 nt2.5□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YPR089WYPR089W 2667 nt2.5□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YDL011CYDL011C 324 nt2.5□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.5□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 PSY1YKL076C 384 nt2.5□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 UTP30YKR060W 825 nt2.5□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 FCF2YLR051C 654 nt2.5□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 FPR1YNL135C 345 nt2.5□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YPR203WYPR203W 309 nt2.5□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 snR36snR36 182 nt2.5□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 SCP160YJL080C 3669 nt2.5□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 FIR1YER032W 2631 nt2.49□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YER121WYER121W 345 nt2.49□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YFL032WYFL032W 321 nt2.49□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 GCV2YMR189W 3105 nt2.49□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 STE11YLR362W 2154 nt2.49□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 KAR3YPR141C 2190 nt2.49□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 UTP14YML093W 2700 nt2.48□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 WIP1YDR374W-A 270 nt2.48□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 ISF1YMR081C 1017 nt2.48□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YBL073WYBL073W 312 nt2.48□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YPL182CYPL182C 384 nt2.48□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 BNR1YIL159W 4128 nt2.48□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 MET6YER091C 2304 nt2.48□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 TMN3YER113C 2121 nt2.48□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 TOR1YJR066W 7413 nt2.47□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 UBP1YDL122W 2430 nt2.47□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 DAD4YDR320C-A 219 nt2.47□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.47□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 ARP8YOR141C 2646 nt2.47□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 GEA1YJR031C 4227 nt2.47□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 NCL1YBL024W 2055 nt2.46□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 ESC1YMR219W 4977 nt2.46□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 UBP11YKR098C 2154 nt2.46□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 IPT1YDR072C 1584 nt2.46□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 snR65snR65 100 nt2.46□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 YDR209CYDR209C 414 nt2.46□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 SDC1YDR469W 528 nt2.46□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 RPS24AYER074W 408 nt2.46□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 YKL083WYKL083W 615 nt2.46□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 LSM7YNL147W 348 nt2.46□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 ATG11YPR049C 3537 nt2.46□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 PRP6YBR055C 2700 nt2.46□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 PTC5YOR090C 1719 nt2.45□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 MPH1YIR002C 2982 nt2.45□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.45□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 RPL36AYMR194W 303 nt2.45□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 HCH1YNL281W 462 nt2.45□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 RTC6YPL183W-A 282 nt2.45□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 YPL229WYPL229W 621 nt2.45□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 YJL070CYJL070C 2667 nt2.45□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 YBP1YBR216C 2025 nt2.45□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 RLI1YDR091C 1827 nt2.45□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.44□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.44□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 YOR282WYOR282W 321 nt2.44□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 APL5YPL195W 2799 nt2.44□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 NFT1YKR103W 3657 nt2.44□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 YGL024WYGL024W 336 nt2.43□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 SHE2YKL130C 741 nt2.43□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 GUP1YGL084C 1683 nt2.43□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 PRK1YIL095W 2433 nt2.42□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 QCR7YDR529C 384 nt2.42□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 YGL239CYGL239C 315 nt2.42□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.42□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 RPL39YJL189W 156 nt2.42□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 GRX8YLR364W 330 nt2.42□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 STE5YDR103W 2754 nt2.42□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 SAK1YER129W 3429 nt2.42□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 SDC25YLL016W 3147 nt2.42□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 SNU114YKL173W 3027 nt2.42□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 NUM1YDR150W 8247 nt2.41□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 YDR366CYDR366C 399 nt2.41□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 VTC1YER072W 390 nt2.41□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 TIM13YGR181W 318 nt2.41□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 HSK3YKL138C-A 210 nt2.41□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 YAR029WYAR029W 225 nt2.41□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 CRS5YOR031W 210 nt2.41□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 HRD3YLR207W 2502 nt2.41□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 AIM9YER080W 1884 nt2.41□□□□□ -2.02
LCB4Q12246 FMP16YDR070C 282 nt2.4□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 SUL1YBR294W 2580 nt2.4□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 SGD1YLR336C 2700 nt2.4□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 BFA1YJR053W 1725 nt2.39□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 DOT6YER088C 2013 nt2.39□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.39□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 SOK2YMR016C 2358 nt2.39□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 SSN2YDR443C 4263 nt2.39□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 NOT5YPR072W 1683 nt2.38□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.38□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 MRD1YPR112C 2664 nt2.38□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 VPS16YPL045W 2397 nt2.38□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 VPS13YLL040C 9435 nt2.38□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 ISW1YBR245C 3390 nt2.38□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 SGO1YOR073W 1773 nt2.37□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 RKM1YPL208W 1752 nt2.37□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.37□□□□□ -2.03
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