Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.48□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.48□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 UTP22YGR090W 3714 nt2.48□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 DUG2YBR281C 2637 nt2.48□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 TPS2YDR074W 2691 nt2.47□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 SSY1YDR160W 2559 nt2.47□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 BRP1YGL007W 378 nt2.47□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 COX7YMR256C 183 nt2.47□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 YBL073WYBL073W 312 nt2.47□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 IRC23YOR044W 474 nt2.47□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 DNL4YOR005C 2835 nt2.47□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 YBP1YBR216C 2025 nt2.47□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 FIR1YER032W 2631 nt2.47□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 SSQ1YLR369W 1974 nt2.47□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 MLH1YMR167W 2310 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 ALK2YBL009W 2031 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 AI2Q0055 2565 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YDL041WYDL041W 354 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 PEX4YGR133W 552 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YIL058WYIL058W 285 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 NUP82YJL061W 2142 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 RPL39YJL189W 156 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 RPL26AYLR344W 384 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 RPL9BYNL067W 576 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YCL019WYCL019W 5313 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YJL016WYJL016W 1686 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 VPS52YDR484W 1926 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 ECM5YMR176W 4236 nt2.46□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 WIP1YDR374W-A 270 nt2.45□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.45□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 ESF2YNR054C 951 nt2.45□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 SIP3YNL257C 3690 nt2.45□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 RPL25YOL127W 429 nt2.44□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 TRA1YHR099W 11235 nt2.44□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 NPR1YNL183C 2373 nt2.44□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 PCF11YDR228C 1881 nt2.43□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 MRP10YDL045W-A 288 nt2.43□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 RPS17BYDR447C 411 nt2.43□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.43□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YFL063WYFL063W 456 nt2.43□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 HYR1YIR037W 492 nt2.43□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 TMA22YJR014W 597 nt2.43□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 ISF1YMR081C 1017 nt2.43□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YPL229WYPL229W 621 nt2.43□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 GUP1YGL084C 1683 nt2.43□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YJL181WYJL181W 1836 nt2.42□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 SSD1YDR293C 3753 nt2.42□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 NOT5YPR072W 1683 nt2.42□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YMR31YFR049W 372 nt2.42□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 FPR1YNL135C 345 nt2.42□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 SPF1YEL031W 3648 nt2.42□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 COG3YER157W 2406 nt2.42□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YPK1YKL126W 2043 nt2.42□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YOL057WYOL057W 2136 nt2.41□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 CDC24YAL041W 2565 nt2.41□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 UFD4YKL010C 4452 nt2.41□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YDL011CYDL011C 324 nt2.41□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.41□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.41□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YCL023CYCL023C 348 nt2.41□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 DNF1YER166W 4716 nt2.41□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 PSD2YGR170W 3417 nt2.4□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 CSF1YLR087C 8877 nt2.4□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YFR016CYFR016C 3702 nt2.4□□□□□ -2.02
DSE3Q08729 YIL166CYIL166C 1629 nt2.4□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YFH1YDL120W 525 nt2.4□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 TIM11YDR322C-A 291 nt2.4□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 SPG3YDR504C 384 nt2.4□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 BNR1YIL159W 4128 nt2.4□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 GCV2YMR189W 3105 nt2.39□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 BRO1YPL084W 2535 nt2.39□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 UTP30YKR060W 825 nt2.39□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 JLP2YMR132C 627 nt2.39□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YOR225WYOR225W 330 nt2.39□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 SEC16YPL085W 6588 nt2.39□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 BOI1YBL085W 2943 nt2.39□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YIL080WYIL080W 4722 nt2.39□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 LEU3YLR451W 2661 nt2.39□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 NAN1YPL126W 2691 nt2.38□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 snR79snR79 84 nt2.38□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YRB1YDR002W 606 nt2.38□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 DAD4YDR320C-A 219 nt2.38□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 EMP24YGL200C 612 nt2.38□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 FCF2YLR051C 654 nt2.38□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 HCH1YNL281W 462 nt2.38□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 MSS11YMR164C 2277 nt2.38□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 SAP185YJL098W 3177 nt2.37□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 HRD3YLR207W 2502 nt2.37□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 IRC10YOL015W 1761 nt2.37□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt2.37□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.37□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YPR146CYPR146C 330 nt2.37□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 SWA2YDR320C 2007 nt2.37□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 RKM1YPL208W 1752 nt2.36□□□□□ -2.03
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