Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 STE11YLR362W 2154 nt2.2□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 FAR11YNL127W 2862 nt2.2□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 BFA1YJR053W 1725 nt2.2□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 NOP10YHR072W-A 177 nt2.2□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 AMS1YGL156W 3252 nt2.2□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 EDS1YBR033W 2760 nt2.2□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 CBF2YGR140W 2871 nt2.2□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 KAR3YPR141C 2190 nt2.19□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 snR70snR70 164 nt2.19□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 SMD1YGR074W 441 nt2.19□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.19□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 YBL108WYBL108W 306 nt2.19□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 KRE33YNL132W 3171 nt2.19□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 BNI1YNL271C 5862 nt2.19□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 HOS4YIL112W 3252 nt2.18□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 WIP1YDR374W-A 270 nt2.18□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 RPS29AYLR388W 171 nt2.18□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 CGI121YML036W 546 nt2.18□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.18□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 VPS35YJL154C 2835 nt2.18□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 SNU114YKL173W 3027 nt2.18□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 INP53YOR109W 3324 nt2.18□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 HSC82YMR186W 2118 nt2.17□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.17□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 FMP16YDR070C 282 nt2.17□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.17□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 UTP30YKR060W 825 nt2.17□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 VTI1YMR197C 654 nt2.17□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.17□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 DAD3YBR233W-A 285 nt2.17□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 YPP1YGR198W 2454 nt2.16□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 YJR003CYJR003C 1560 nt2.16□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 SDC1YDR469W 528 nt2.16□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 QCR7YDR529C 384 nt2.16□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 PEX4YGR133W 552 nt2.16□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 DNF1YER166W 4716 nt2.16□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 IRA2YOL081W 9240 nt2.15□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 SWA2YDR320C 2007 nt2.15□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 TOF1YNL273W 3717 nt2.15□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 SGS1YMR190C 4344 nt2.15□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.15□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.15□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.15□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YPL225WYPL225W 441 nt2.15□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 UBP15YMR304W 3693 nt2.15□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 SCD5YOR329C 2619 nt2.15□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 OSW7YFR039C 1533 nt2.14□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 PHO91YNR013C 2685 nt2.14□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YDL011CYDL011C 324 nt2.14□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YJR011CYJR011C 786 nt2.14□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 MRPL31YKL138C 396 nt2.14□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 RPL9BYNL067W 576 nt2.14□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 snR43snR43 209 nt2.14□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 NEW1YPL226W 3591 nt2.14□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 TAE2YPL009C 3117 nt2.14□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YNL018CYNL018C 1839 nt2.14□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 FKS3YMR306W 5358 nt2.14□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 STH1YIL126W 4080 nt2.13□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 USO1YDL058W 5373 nt2.13□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 SMC6YLR383W 3345 nt2.13□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 MRP10YDL045W-A 288 nt2.13□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YGL024WYGL024W 336 nt2.13□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.13□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 RPL40BYKR094C 387 nt2.13□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 RPL26AYLR344W 384 nt2.13□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 SPO22YIL073C 2928 nt2.13□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 SGD1YLR336C 2700 nt2.12□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YDR186CYDR186C 2634 nt2.12□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YRB1YDR002W 606 nt2.12□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 TWF1YGR080W 999 nt2.12□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.12□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 SNC2YOR327C 348 nt2.12□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YPL182CYPL182C 384 nt2.12□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YEL043WYEL043W 2871 nt2.12□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 DNA2YHR164C 4569 nt2.12□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 MGM1YOR211C 2646 nt2.12□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 SSD1YDR293C 3753 nt2.12□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 IRC8YJL051W 2469 nt2.11□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 MSB1YOR188W 3414 nt2.11□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YGL239CYGL239C 315 nt2.11□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 MSL1YIR009W 336 nt2.11□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 SNC1YAL030W 354 nt2.11□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 ISF1YMR081C 1017 nt2.11□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YMR320WYMR320W 306 nt2.11□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YNL146WYNL146W 303 nt2.11□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 VMA9YCL005W-A 222 nt2.11□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 PDR11YIL013C 4236 nt2.11□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 SLN1YIL147C 3663 nt2.11□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 SEC16YPL085W 6588 nt2.11□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 BUB1YGR188C 3066 nt2.1□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 GIS1YDR096W 2685 nt2.1□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 TRS130YMR218C 3309 nt2.1□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 PCF11YDR228C 1881 nt2.1□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.1□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 EMC6YLL014W 327 nt2.1□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.1□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 RRP6YOR001W 2202 nt2.09□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 INO80YGL150C 4470 nt2.09□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 CDC50YCR094W 1176 nt2.09□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 YAR053WYAR053W 297 nt2.09□□□□□ -2.07
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