Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 SYT1YPR095C 3681 nt3.59□□□□□ -1.83
HDA3Q06623 URA2YJL130C 6645 nt3.59□□□□□ -1.83
HDA3Q06623 NPR3YHL023C 3441 nt3.59□□□□□ -1.83
HDA3Q06623 CFT2YLR115W 2580 nt3.59□□□□□ -1.83
HDA3Q06623 SPA2YLL021W 4401 nt3.59□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 SPT21YMR179W 2277 nt3.58□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 VPS53YJL029C 2469 nt3.58□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 VMA9YCL005W-A 222 nt3.58□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 SAK1YER129W 3429 nt3.58□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 EPL1YFL024C 2499 nt3.58□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 RAD5YLR032W 3510 nt3.57□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 XRS2YDR369C 2565 nt3.57□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.57□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 ITC1YGL133W 3795 nt3.57□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt3.57□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 SWI1YPL016W 3945 nt3.57□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 YGL140CYGL140C 3660 nt3.57□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 EFR3YMR212C 2349 nt3.56□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 SWA2YDR320C 2007 nt3.56□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 PEX8YGR077C 1770 nt3.56□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 snR74snR74 88 nt3.56□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 RPL34BYIL052C 366 nt3.56□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 COX14YML129C 213 nt3.56□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 DIA2YOR080W 2199 nt3.56□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 GLC3YEL011W 2115 nt3.56□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 HSC82YMR186W 2118 nt3.56□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 YOL057WYOL057W 2136 nt3.56□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 PLC1YPL268W 2610 nt3.56□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 MPH1YIR002C 2982 nt3.55□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 PUF4YGL014W 2667 nt3.55□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 YML037CYML037C 1023 nt3.55□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 MDV1YJL112W 2145 nt3.55□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 ULI1YFR026C 510 nt3.54□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 COX19YLL018C-A 297 nt3.54□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 GRX8YLR364W 330 nt3.54□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 SGF11YPL047W 300 nt3.54□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 MUK1YPL070W 1839 nt3.54□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 DAN4YJR151C 3486 nt3.53□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 NAB3YPL190C 2409 nt3.53□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 IKI3YLR384C 4050 nt3.53□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 YLL007CYLL007C 1998 nt3.53□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 PRP42YDR235W 1635 nt3.53□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt3.53□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.53□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 LSM7YNL147W 348 nt3.53□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 VPH1YOR270C 2523 nt3.53□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 ORC1YML065W 2745 nt3.53□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 GIS4YML006C 2325 nt3.53□□□□□ -1.84
HDA3Q06623 YTA7YGR270W 4140 nt3.52□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 TAF1YGR274C 3201 nt3.52□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 KAP95YLR347C 2586 nt3.52□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 ARO1YDR127W 4767 nt3.51□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 YAT2YER024W 2772 nt3.51□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 COS111YBR203W 2775 nt3.51□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt3.51□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 SMC2YFR031C 3513 nt3.5□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 HEF3YNL014W 3135 nt3.5□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 ANB1YJR047C 474 nt3.5□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 YBL065WYBL065W 345 nt3.5□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 RPS8AYBL072C 603 nt3.5□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt3.5□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 LRG1YDL240W 3054 nt3.5□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 SNT1YCR033W 3681 nt3.5□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt3.49□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 PSF1YDR013W 627 nt3.49□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 TMA19YKL056C 504 nt3.49□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 NOP53YPL146C 1368 nt3.49□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 PTC5YOR090C 1719 nt3.48□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 YEL073CYEL073C 324 nt3.48□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.48□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.48□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 INP2YMR163C 2118 nt3.48□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 VPS35YJL154C 2835 nt3.48□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 MTR4YJL050W 3222 nt3.48□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 STE23YLR389C 3084 nt3.48□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 ALA1YOR335C 2877 nt3.48□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 SET1YHR119W 3243 nt3.47□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.47□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 RIX1YHR197W 2292 nt3.47□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 YEL043WYEL043W 2871 nt3.47□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 SSQ1YLR369W 1974 nt3.47□□□□□ -1.85
HDA3Q06623 ECM12YHR021W-A 456 nt3.46□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 ZDS2YML109W 2829 nt3.46□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 HEH2YDR458C 1992 nt3.45□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 snR76snR76 109 nt3.45□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 YHR210CYHR210C 1026 nt3.45□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 GIS2YNL255C 462 nt3.45□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 YOR218CYOR218C 420 nt3.45□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 MDN1YLR106C 14733 nt3.45□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.44□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 RGM1YMR182C 636 nt3.44□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 RAD2YGR258C 3096 nt3.44□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 AI2Q0055 2565 nt3.44□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 UBP11YKR098C 2154 nt3.44□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 RSN1YMR266W 2862 nt3.43□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 SMC3YJL074C 3693 nt3.43□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 PSY2YNL201C 2577 nt3.43□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 TAF2YCR042C 4224 nt3.43□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt3.42□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 VPS34YLR240W 2628 nt3.42□□□□□ -1.86
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