Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms