Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms