Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KRW8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KRW8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
J3KRW8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3KRW8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3KRW8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3KRW8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3KRW8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3KRW8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3KRW8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KRW8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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