Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms