Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms