Protein–RNA interactions for Protein: Q9P107

GMIP, GEM-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMIPQ9P107 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMIPQ9P107 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMIPQ9P107 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GMIPQ9P107 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMIPQ9P107 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms