Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms