Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 YGL036WYGL036W 2730 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 SEN1YLR430W 6696 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 AKL1YBR059C 3327 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 GIS4YML006C 2325 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 YCG1YDR325W 3108 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 SWI1YPL016W 3945 nt3.94□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 RPG1YBR079C 2895 nt3.94□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 CLN3YAL040C 1743 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 DBP7YKR024C 2229 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 YNL211CYNL211C 261 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 VPH1YOR270C 2523 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 YPK9YOR291W 4419 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 SOK1YDR006C 2706 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 EGT2YNL327W 3126 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 VMA9YCL005W-A 222 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 VMA1YDL185W 3216 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 EXO84YBR102C 2262 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 PTC5YOR090C 1719 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 ECM22YLR228C 2445 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 YLR352WYLR352W 2424 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 DIP2YLR129W 2832 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 INP2YMR163C 2118 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-BRQ12217 EMC6YLL014W 327 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 BCH1YMR237W 2175 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 PEP5YMR231W 3090 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 YIL174WYIL174W 228 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 RSM19YNR037C 276 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 snR45snR45 172 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 BNI4YNL233W 2679 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 SGD1YLR336C 2700 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 REG1YDR028C 3045 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 NCA2YPR155C 1851 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 PSK2YOL045W 3306 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 PRP22YER013W 3438 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 SEC15YGL233W 2733 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 PAA1YDR071C 576 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 YGR050CYGR050C 357 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 RPL25YOL127W 429 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 YOR318CYOR318C 306 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 TIM12YBR091C 330 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 JEN1YKL217W 1851 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 GSC2YGR032W 5688 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 SNF2YOR290C 5112 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 TMA108YIL137C 2841 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 SRO7YPR032W 3102 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 ZRG17YNR039C 1818 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 HOS3YPL116W 2094 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 HYP2YEL034W 474 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 YMR31YFR049W 372 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 BRE4YDL231C 3378 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-BRQ12217 KGD1YIL125W 3045 nt3.84□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 CHS3YBR023C 3498 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 NTO1YPR031W 2247 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 OST4YDL232W 111 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 CMC4YMR194C-B 222 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 USA1YML029W 2517 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 CCM1YGR150C 2595 nt3.82□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 ATG2YNL242W 4779 nt3.82□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 RLI1YDR091C 1827 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 FAR1YJL157C 2493 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 YIL165CYIL165C 360 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 GRX8YLR364W 330 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 RTC6YPL183W-A 282 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 BCK2YER167W 2556 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 MET10YFR030W 3108 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 TRK1YJL129C 3708 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 MPT5YGL178W 2580 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 ULS1YOR191W 4860 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 YBR206WYBR206W 324 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 NUP133YKR082W 3474 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 PSO2YMR137C 1986 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 MCD4YKL165C 2760 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 RPL22AYLR061W 366 nt3.79□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 MTR10YOR160W 2919 nt3.79□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 FLO8YER109C 2400 nt3.79□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 NAB3YPL190C 2409 nt3.79□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 snR7-SsnR7-S 179 nt3.78□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.78□□□□□ -1.8
TY1A-BRQ12217 PUF4YGL014W 2667 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BRQ12217 RSN1YMR266W 2862 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BRQ12217 YBR174CYBR174C 315 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BRQ12217 TOP1YOL006C 2310 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BRQ12217 APC1YNL172W 5247 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BRQ12217 RRM3YHR031C 2172 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1A-BRQ12217 GIS1YDR096W 2685 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1A-BRQ12217 POM152YMR129W 4014 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1A-BRQ12217 TIM11YDR322C-A 291 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1A-BRQ12217 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1A-BRQ12217 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt3.76□□□□□ -1.81
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