Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 AI2Q0055 2565 nt4.49□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 CFT2YLR115W 2580 nt4.48□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 TIM11YDR322C-A 291 nt4.48□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 LCL1YPL056C 306 nt4.48□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.48□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 SLP1YOR154W 1764 nt4.48□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 CYM1YDR430C 2970 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 snR75snR75 89 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 QCR7YDR529C 384 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 SUP56tL(CAA)A 82 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 SUP53tL(CAA)C 82 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 SUP54tL(CAA)G2 82 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 MCM2YBL023C 2607 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 HBT1YDL223C 3141 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 APL5YPL195W 2799 nt4.47□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 SKG6YHR149C 2205 nt4.46□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 DOA4YDR069C 2781 nt4.46□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 YFL065CYFL065C 309 nt4.46□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 PAU13YHL046C 363 nt4.46□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 YIL058WYIL058W 285 nt4.46□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 YPR203WYPR203W 309 nt4.46□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 CTF4YPR135W 2784 nt4.46□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 MPT5YGL178W 2580 nt4.46□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 LYS14YDR034C 2373 nt4.46□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 UPC2YDR213W 2742 nt4.45□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 PUT2YHR037W 1728 nt4.45□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 SIP1YDR422C 2448 nt4.45□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 IOC3YFR013W 2364 nt4.45□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 UBP12YJL197W 3765 nt4.44□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 OAF1YAL051W 3144 nt4.44□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 SNU114YKL173W 3027 nt4.44□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 NCA2YPR155C 1851 nt4.44□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 EBS1YDR206W 2655 nt4.44□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 VIP1YLR410W 3441 nt4.44□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 SYF1YDR416W 2580 nt4.44□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 ARG5,6YER069W 2592 nt4.43□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt4.43□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 RPL23AYBL087C 414 nt4.43□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 RPL25YOL127W 429 nt4.43□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 SPC105YGL093W 2754 nt4.43□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 MCD4YKL165C 2760 nt4.43□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 TEL1YBL088C 8364 nt4.42□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 YGL069CYGL069C 465 nt4.42□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 SRS2YJL092W 3525 nt4.42□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 RIA1YNL163C 3333 nt4.42□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 YOL075CYOL075C 3885 nt4.42□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 RIX1YHR197W 2292 nt4.41□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 RPL31AYDL075W 342 nt4.41□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 YDL196WYDL196W 330 nt4.41□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt4.41□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt4.41□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 PIM1YBL022C 3402 nt4.41□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 TGL4YKR089C 2733 nt4.41□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 TRZ1YKR079C 2517 nt4.4□□□□□ -1.7
NCR1Q12200 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt4.4□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt4.4□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 VAC7YNL054W 3498 nt4.4□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 HFA1YMR207C 6372 nt4.39□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 ELG1YOR144C 2376 nt4.39□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 BRO1YPL084W 2535 nt4.39□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 PEP3YLR148W 2757 nt4.39□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 YGR050CYGR050C 357 nt4.38□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 FUN12YAL035W 3009 nt4.38□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 PMC1YGL006W 3522 nt4.38□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 SWI1YPL016W 3945 nt4.37□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 FAA2YER015W 2235 nt4.37□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 CDH1YGL003C 1701 nt4.37□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 TAF6YGL112C 1551 nt4.36□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 FAS2YPL231W 5664 nt4.36□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 PDR8YLR266C 2106 nt4.36□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 VTC4YJL012C 2166 nt4.35□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 PTC5YOR090C 1719 nt4.35□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 AVT1YJR001W 1809 nt4.35□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 YNL034WYNL034W 1839 nt4.35□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 REC8YPR007C 2043 nt4.34□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 ROD1YOR018W 2514 nt4.34□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 GAL11YOL051W 3246 nt4.34□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 YER039C-AYER039C-A 219 nt4.34□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 YGR269WYGR269W 327 nt4.34□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 RPL14AYKL006W 417 nt4.34□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 YMR324CYMR324C 243 nt4.34□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 YBL065WYBL065W 345 nt4.34□□□□□ -1.71
NCR1Q12200 EFR3YMR212C 2349 nt4.33□□□□□ -1.72
NCR1Q12200 RDH54YBR073W 2877 nt4.33□□□□□ -1.72
NCR1Q12200 YGR237CYGR237C 2358 nt4.33□□□□□ -1.72
NCR1Q12200 ALK2YBL009W 2031 nt4.33□□□□□ -1.72
NCR1Q12200 RAD1YPL022W 3303 nt4.33□□□□□ -1.72
NCR1Q12200 PDR12YPL058C 4536 nt4.32□□□□□ -1.72
NCR1Q12200 FIG4YNL325C 2640 nt4.32□□□□□ -1.72
NCR1Q12200 CDC20YGL116W 1833 nt4.32□□□□□ -1.72
NCR1Q12200 MNR2YKL064W 2910 nt4.31□□□□□ -1.72
NCR1Q12200 DYN2YDR424C 279 nt4.31□□□□□ -1.72
NCR1Q12200 HYP2YEL034W 474 nt4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.3 ms