Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 YDL068WYDL068W 330 nt2.41□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 YKL111CYKL111C 336 nt2.41□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 YLR379WYLR379W 375 nt2.41□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 RUF22RUF22 515 nt2.41□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 STH1YIL126W 4080 nt2.41□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 MSL5YLR116W 1431 nt2.41□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 SAK1YER129W 3429 nt2.4□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 ASM4YDL088C 1587 nt2.4□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 RVS161YCR009C 798 nt2.4□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.4□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.4□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 RPI1YIL119C 1224 nt2.4□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YJR157WYJR157W 363 nt2.4□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YLR171WYLR171W 390 nt2.4□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 LSM7YNL147W 348 nt2.4□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.4□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.4□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.4□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.4□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 NUP82YJL061W 2142 nt2.39□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YCR001WYCR001W 315 nt2.39□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.39□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 RPL27BYDR471W 411 nt2.39□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 BI2Q0110 1272 nt2.39□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 SEN15YMR059W 387 nt2.39□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 ATP3YBR039W 936 nt2.39□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 SLM6YBR266C 453 nt2.39□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 RRP6YOR001W 2202 nt2.39□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 MPH1YIR002C 2982 nt2.39□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.39□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 SPP41YDR464W 4308 nt2.38□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 NAN1YPL126W 2691 nt2.38□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 RPC10YHR143W-A 213 nt2.38□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 PAU8YAL068C 363 nt2.38□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YLR031WYLR031W 561 nt2.38□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 SIR3YLR442C 2937 nt2.38□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 PAU20YOL161C 363 nt2.38□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 BRE1YDL074C 2103 nt2.38□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YJL016WYJL016W 1686 nt2.37□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 SEC31YDL195W 3822 nt2.37□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 BNI1YNL271C 5862 nt2.37□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 MZM1YDR493W 372 nt2.37□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 VAR1Q0140 1197 nt2.37□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.37□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YJL007CYJL007C 315 nt2.37□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 NCE101YJL205C 162 nt2.37□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 SYM1YLR251W 594 nt2.37□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YML108WYML108W 318 nt2.37□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YNL010WYNL010W 726 nt2.37□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 DAD3YBR233W-A 285 nt2.37□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 SGM1YJR134C 2124 nt2.36□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 UBP2YOR124C 3819 nt2.36□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 PET191YJR034W 327 nt2.36□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 IRC19YLL033W 693 nt2.36□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 ROX1YPR065W 1107 nt2.36□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 IPT1YDR072C 1584 nt2.36□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 RNH70YGR276C 1662 nt2.35□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YRB1YDR002W 606 nt2.35□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.35□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 GRX8YLR364W 330 nt2.35□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 SPC29YPL124W 762 nt2.35□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 RTT107YHR154W 3213 nt2.34□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.34□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 VOA1YGR106C 798 nt2.34□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.34□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 RPS17AYML024W 411 nt2.34□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 FYV12YOR183W 390 nt2.34□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 YOR248WYOR248W 303 nt2.34□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 MUD2YKL074C 1584 nt2.34□□□□□ -2.03
CTI6Q08923 PHO2YDL106C 1680 nt2.34□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 UBR1YGR184C 5853 nt2.33□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 CDC50YCR094W 1176 nt2.33□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 TIM9YEL020W-A 264 nt2.33□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 ECL1YGR146C 636 nt2.33□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 NOP10YHR072W-A 177 nt2.33□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 UTP30YKR060W 825 nt2.33□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 AIM29YKR074W 468 nt2.33□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 GIP3YPL137C 3831 nt2.33□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 snR54snR54 86 nt2.33□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 BFA1YJR053W 1725 nt2.33□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.32□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.32□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YGL024WYGL024W 336 nt2.32□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 SMD1YGR074W 441 nt2.32□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 MSL1YIR009W 336 nt2.32□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.32□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 VTI1YMR197C 654 nt2.32□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 TOM22YNL131W 459 nt2.32□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YPL205CYPL205C 345 nt2.32□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 PPN1YDR452W 2025 nt2.32□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 AFI1YOR129C 2682 nt2.31□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 VPS52YDR484W 1926 nt2.31□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YHR125WYHR125W 306 nt2.31□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.31□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 SNC1YAL030W 354 nt2.31□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YAR068WYAR068W 486 nt2.31□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.31□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 MCD1YDL003W 1701 nt2.31□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 DIS3YOL021C 3006 nt2.3□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YDL041WYDL041W 354 nt2.3□□□□□ -2.04
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