Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms