Protein–RNA interactions for Protein: P23508

MCC, Colorectal mutant cancer protein, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCP23508 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCP23508 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCP23508 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCP23508 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCP23508 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCP23508 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCP23508 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCP23508 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCP23508 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCP23508 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCP23508 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCP23508 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCP23508 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCCP23508 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCP23508 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCP23508 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCP23508 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCP23508 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCP23508 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCP23508 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCP23508 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCP23508 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCP23508 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCP23508 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCP23508 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCP23508 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCP23508 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCP23508 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCP23508 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCP23508 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCP23508 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCP23508 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCP23508 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms