Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO3A2RU48 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms