Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms