Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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