Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.78□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.78□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.78□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.78□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 YLR255CYLR255C 354 nt3.78□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 YPL278CYPL278C 303 nt3.78□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt3.78□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 YBR277CYBR277C 402 nt3.78□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 FAS2YPL231W 5664 nt3.78□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 GCD6YDR211W 2139 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 RAD1YPL022W 3303 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 ALO1YML086C 1581 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 YCF1YDR135C 4548 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 YER053C-AYER053C-A 114 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 YER121WYER121W 345 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 YIL058WYIL058W 285 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 TRX1YLR043C 312 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 YJL181WYJL181W 1836 nt3.77□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 KEL2YGR238C 2649 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 TFC8YPL007C 1767 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 DIS3YOL021C 3006 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 PDR5YOR153W 4536 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 ACM1YPL267W 630 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 BRE4YDL231C 3378 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 LYP1YNL268W 1836 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 PEX1YKL197C 3132 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 NAT1YDL040C 2565 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 VHS3YOR054C 2025 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 ULS1YOR191W 4860 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 snR62snR62 100 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 ECM12YHR021W-A 456 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 snR45snR45 172 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 CDH1YGL003C 1701 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 ADP1YCR011C 3150 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 SPT21YMR179W 2277 nt3.74□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt3.74□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.74□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 RDN5-1RDN5-1 121 nt3.74□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 FMP46YKR049C 402 nt3.74□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 ACE2YLR131C 2313 nt3.74□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 RDN5-6RDN5-6 121 nt3.74□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 GAL11YOL051W 3246 nt3.74□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 YOR102WYOR102W 351 nt3.74□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 GCR1YPL075W 2358 nt3.73□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 RPS7AYOR096W 573 nt3.73□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 NSP1YJL041W 2472 nt3.73□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 ETP1YHL010C 1758 nt3.73□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 GRS2YPR081C 1857 nt3.73□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 YGR237CYGR237C 2358 nt3.73□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 TCO89YPL180W 2400 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 GYL1YMR192W 2163 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 YIR044CYIR044C 186 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 FUN12YAL035W 3009 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 BAS1YKR099W 2436 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 YNL034WYNL034W 1839 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 VMA1YDL185W 3216 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 ATG2YNL242W 4779 nt3.71□□□□□ -1.81
TY1A-BLQ12266 NUP133YKR082W 3474 nt3.71□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 PIM1YBL022C 3402 nt3.71□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 RPL14AYKL006W 417 nt3.71□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt3.71□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 OM14YBR230C 405 nt3.71□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 GPI1YGR216C 1830 nt3.71□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 SNU114YKL173W 3027 nt3.71□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 YAK1YJL141C 2424 nt3.71□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 BRO1YPL084W 2535 nt3.71□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 YLR282CYLR282C 342 nt3.7□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 YOR345CYOR345C 351 nt3.7□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 LEU3YLR451W 2661 nt3.7□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 DOA4YDR069C 2781 nt3.7□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 ECM5YMR176W 4236 nt3.7□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 MTR10YOR160W 2919 nt3.69□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 GPI13YLL031C 3054 nt3.69□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.69□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 ECM22YLR228C 2445 nt3.69□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 TMN3YER113C 2121 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 HSC82YMR186W 2118 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 VTC4YJL012C 2166 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 QCR7YDR529C 384 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 COX23YHR116W 456 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 FPR1YNL135C 345 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 DFG16YOR030W 1860 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 SRO7YPR032W 3102 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 APC1YNL172W 5247 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 NMA111YNL123W 2994 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 BCK2YER167W 2556 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 RRN6YBL014C 2685 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 MUS81YDR386W 1899 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 SIR3YLR442C 2937 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 COX14YML129C 213 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 FAA1YOR317W 2103 nt3.65□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 COY1YKL179C 2040 nt3.65□□□□□ -1.82
TY1A-BLQ12266 NUP85YJR042W 2235 nt3.65□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YIL174WYIL174W 228 nt3.65□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt3.65□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 KHA1YJL094C 2622 nt3.65□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 FOX2YKR009C 2703 nt3.64□□□□□ -1.83
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