Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 LSM2YBL026W 288 nt1.49□□□□□ -2.17
USB1Q12208 IPP1YBR011C 864 nt1.49□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YPL238CYPL238C 390 nt1.49□□□□□ -2.17
USB1Q12208 VID24YBR105C 1089 nt1.49□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YJR039WYJR039W 3366 nt1.49□□□□□ -2.17
USB1Q12208 snR59snR59 78 nt1.48□□□□□ -2.17
USB1Q12208 PBP4YDL053C 558 nt1.48□□□□□ -2.17
USB1Q12208 VPS74YDR372C 1038 nt1.48□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YGR115CYGR115C 780 nt1.48□□□□□ -2.17
USB1Q12208 SPO11YHL022C 1197 nt1.48□□□□□ -2.17
USB1Q12208 SDL1YIL167W 633 nt1.48□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YJL086CYJL086C 369 nt1.48□□□□□ -2.17
USB1Q12208 VPS63YLR261C 327 nt1.48□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YLR302CYLR302C 363 nt1.48□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YNL179CYNL179C 438 nt1.48□□□□□ -2.17
USB1Q12208 TAZ1YPR140W 1146 nt1.48□□□□□ -2.17
USB1Q12208 CFT1YDR301W 4074 nt1.48□□□□□ -2.17
USB1Q12208 ARP7YPR034W 1434 nt1.48□□□□□ -2.17
USB1Q12208 FIG2YCR089W 4830 nt1.47□□□□□ -2.17
USB1Q12208 TDA9YML081W 3756 nt1.47□□□□□ -2.17
USB1Q12208 TDA2YER071C 381 nt1.47□□□□□ -2.17
USB1Q12208 PGD1YGL025C 1194 nt1.47□□□□□ -2.17
USB1Q12208 ERG29YMR134W 714 nt1.47□□□□□ -2.17
USB1Q12208 MRPL44YMR225C 297 nt1.47□□□□□ -2.17
USB1Q12208 HHT2YNL031C 411 nt1.47□□□□□ -2.17
USB1Q12208 FYV12YOR183W 390 nt1.47□□□□□ -2.17
USB1Q12208 POP7YBR167C 423 nt1.47□□□□□ -2.17
USB1Q12208 UTP21YLR409C 2820 nt1.46□□□□□ -2.18
USB1Q12208 RSM18YER050C 417 nt1.46□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1.46□□□□□ -2.18
USB1Q12208 NCE101YJL205C 162 nt1.46□□□□□ -2.18
USB1Q12208 SRP21YKL122C 504 nt1.46□□□□□ -2.18
USB1Q12208 SYM1YLR251W 594 nt1.46□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YOR019WYOR019W 2193 nt1.46□□□□□ -2.18
USB1Q12208 VMR1YHL035C 4779 nt1.45□□□□□ -2.18
USB1Q12208 snR5snR5 204 nt1.45□□□□□ -2.18
USB1Q12208 HOP2YGL033W 657 nt1.45□□□□□ -2.18
USB1Q12208 SEC28YIL076W 891 nt1.45□□□□□ -2.18
USB1Q12208 HYR1YIR037W 492 nt1.45□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YPT6YLR262C 648 nt1.45□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.45□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YOR146WYOR146W 306 nt1.45□□□□□ -2.18
USB1Q12208 RPH1YER169W 2391 nt1.45□□□□□ -2.18
USB1Q12208 SPC72YAL047C 1869 nt1.45□□□□□ -2.18
USB1Q12208 NCL1YBL024W 2055 nt1.44□□□□□ -2.18
USB1Q12208 CRD1YDL142C 852 nt1.44□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.44□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.44□□□□□ -2.18
USB1Q12208 ACF4YJR083C 930 nt1.44□□□□□ -2.18
USB1Q12208 CSE4YKL049C 690 nt1.44□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YNL319WYNL319W 441 nt1.44□□□□□ -2.18
USB1Q12208 ATP15YPL271W 189 nt1.44□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YPR170CYPR170C 336 nt1.44□□□□□ -2.18
USB1Q12208 BFA1YJR053W 1725 nt1.43□□□□□ -2.18
USB1Q12208 SEC63YOR254C 1992 nt1.43□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt1.43□□□□□ -2.18
USB1Q12208 RAD6YGL058W 519 nt1.43□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YLR419WYLR419W 4308 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YDL062WYDL062W 426 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 snR83snR83 306 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 DAD1YDR016C 285 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 BTT1YDR252W 450 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 TSA2YDR453C 591 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YGL109WYGL109W 324 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YJR023CYJR023C 402 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 RAM2YKL019W 951 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 RPC25YKL144C 639 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YLR031WYLR031W 561 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YMR254CYMR254C 309 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 LSM7YNL147W 348 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 RPB5YBR154C 648 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 TRS20YBR254C 528 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YCL002CYCL002C 792 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 SHE4YOR035C 2370 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 NDD1YOR372C 1665 nt1.42□□□□□ -2.18
USB1Q12208 Q0255Q0255 1419 nt1.41□□□□□ -2.18
USB1Q12208 IRA1YBR140C 9279 nt1.41□□□□□ -2.18
USB1Q12208 NOP10YHR072W-A 177 nt1.41□□□□□ -2.18
USB1Q12208 SDS22YKL193C 1017 nt1.41□□□□□ -2.18
USB1Q12208 ATP18YML081C-A 180 nt1.41□□□□□ -2.18
USB1Q12208 CRM1YGR218W 3255 nt1.41□□□□□ -2.18
USB1Q12208 SAC3YDR159W 3906 nt1.4□□□□□ -2.18
USB1Q12208 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 IRC2YDR112W 309 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YDR286CYDR286C 345 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 ATP17YDR377W 306 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 DFG10YIL049W 762 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YIL082WYIL082W 873 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 RPL40AYIL148W 387 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 PEP8YJL053W 1140 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 OST2YOR103C 393 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 SPO24YPR036W-A 204 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 MON2YNL297C 4911 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 CHS1YNL192W 3396 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 TRM3YDL112W 4311 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 PMD1YER132C 5262 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 MSH6YDR097C 3729 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 SBE22YHR103W 2559 nt1.4□□□□□ -2.19
USB1Q12208 LYS9YNR050C 1341 nt1.4□□□□□ -2.19
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