Protein–RNA interactions for Protein: Q07532

IWR1, RNA polymerase II nuclear localization protein IWR1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 353 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IWR1	Q07532	FRE2	YKL220C	2136 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	RPL40A	YIL148W	387 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	NCE101	YJL205C	162 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	LCL2	YLR104W	396 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YML084W	YML084W	309 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	snR43	snR43	209 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	SDC25	YLL016W	3147 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YBT1	YLL048C	4986 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	FLO11	YIR019C	4104 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	SAP1	YER047C	2694 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YPR089W	YPR089W	2667 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	ESL2	YKR096W	3588 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	PDR3	YBL005W	2931 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	NIC96	YFR002W	2520 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	NUP82	YJL061W	2142 nt		2.71	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YJL016W	YJL016W	1686 nt		2.7	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	BNR1	YIL159W	4128 nt		2.7	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	GIM4	YEL003W	336 nt		2.7	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YAL042C-A	YAL042C-A	378 nt		2.7	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	CCW14	YLR390W-A	717 nt		2.7	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	CRS5	YOR031W	210 nt		2.7	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YOR293C-A	YOR293C-A	150 nt		2.7	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	KSP1	YHR082C	3090 nt		2.7	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YJL181W	YJL181W	1836 nt		2.7	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	CAF120	YNL278W	3183 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YDR098C-B	YDR098C-B	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YDR210C-D	YDR210C-D	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YDR316W-B	YDR316W-B	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YDR365W-B	YDR365W-B	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YER138C	YER138C	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YER160C	YER160C	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YGR038C-B	YGR038C-B	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YGR161C-D	YGR161C-D	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YJR027W	YJR027W	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YLR157C-B	YLR157C-B	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YML039W	YML039W	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YML045W	YML045W	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YMR050C	YMR050C	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YOL103W-B	YOL103W-B	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YBR012W-B	YBR012W-B	5271 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YOR142W-B	YOR142W-B	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YPL257W-B	YPL257W-B	5268 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YPR158W-B	YPR158W-B	5271 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	SWF1	YDR126W	1011 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	ZEO1	YOL109W	342 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	PRP8	YHR165C	7242 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	UTP14	YML093W	2700 nt		2.69	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	PES4	YFR023W	1836 nt		2.68	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	PRP6	YBR055C	2700 nt		2.68	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	PET191	YJR034W	327 nt		2.68	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	EMC6	YLL014W	327 nt		2.68	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	ERP4	YOR016C	624 nt		2.68	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YOR050C	YOR050C	348 nt		2.68	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YOR053W	YOR053W	342 nt		2.68	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YOR392W	YOR392W	444 nt		2.68	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YBR085C-A	YBR085C-A	258 nt		2.68	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YBR285W	YBR285W	435 nt		2.68	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	SUL1	YBR294W	2580 nt		2.67	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	PFF1	YBR074W	2931 nt		2.67	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	SLN1	YIL147C	3663 nt		2.67	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YHR028W-A	YHR028W-A	321 nt		2.67	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YHR139C-A	YHR139C-A	312 nt		2.67	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YJL202C	YJL202C	348 nt		2.67	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	COX7	YMR256C	183 nt		2.67	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YSW1	YBR148W	1830 nt		2.67	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	SNX41	YDR425W	1878 nt		2.67	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	NUM1	YDR150W	8247 nt		2.66	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YER068C-A	YER068C-A	432 nt		2.66	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YHL009W-A	YHL009W-A	1242 nt		2.66	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	YLR031W	YLR031W	561 nt		2.66	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	VPS52	YDR484W	1926 nt		2.66	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	GEA1	YJR031C	4227 nt		2.66	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	RGA2	YDR379W	3030 nt		2.66	□□□□□ -1.98
IWR1	Q07532	VOA1	YGR106C	798 nt		2.65	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YAL068W-A	YAL068W-A	255 nt		2.65	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	SRO77	YBL106C	3033 nt		2.64	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YDR186C	YDR186C	2634 nt		2.64	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	RPS1A	YLR441C	768 nt		2.64	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YOR055W	YOR055W	435 nt		2.64	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	RPL36B	YPL249C-A	303 nt		2.64	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	SPC72	YAL047C	1869 nt		2.64	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	HRD3	YLR207W	2502 nt		2.64	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YDL041W	YDL041W	354 nt		2.63	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	SDH7	YDR511W	402 nt		2.63	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YGL014C-A	YGL014C-A	162 nt		2.63	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YOR192C-C	YOR192C-C	237 nt		2.63	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	RRP12	YPL012W	3687 nt		2.63	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	DAS1	YJL149W	1992 nt		2.62	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	UBP11	YKR098C	2154 nt		2.62	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YDR250C	YDR250C	276 nt		2.62	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	AYR1	YIL124W	894 nt		2.62	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YAR047C	YAR047C	321 nt		2.62	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	RPS22B	YLR367W	393 nt		2.62	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	ATP3	YBR039W	936 nt		2.62	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	LCL1	YPL056C	306 nt		2.62	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	ROX1	YPR065W	1107 nt		2.62	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	ARP8	YOR141C	2646 nt		2.62	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	SNU114	YKL173W	3027 nt		2.62	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	NAB6	YML117W	3405 nt		2.62	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	MKT1	YNL085W	2493 nt		2.62	□□□□□ -1.99

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.5 ms