Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00205P59089 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms