Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS1P54277 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS1P54277 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS1P54277 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS1P54277 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS1P54277 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS1P54277 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS1P54277 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS1P54277 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS1P54277 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS1P54277 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS1P54277 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS1P54277 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS1P54277 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS1P54277 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS1P54277 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS1P54277 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS1P54277 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS1P54277 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS1P54277 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS1P54277 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS1P54277 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS1P54277 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS1P54277 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS1P54277 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS1P54277 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PMS1P54277 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS1P54277 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS1P54277 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS1P54277 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS1P54277 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS1P54277 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS1P54277 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS1P54277 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS1P54277 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS1P54277 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS1P54277 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS1P54277 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS1P54277 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS1P54277 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS1P54277 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS1P54277 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms