Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB1P53618 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB1P53618 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB1P53618 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB1P53618 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB1P53618 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB1P53618 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB1P53618 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB1P53618 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPB1P53618 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPB1P53618 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPB1P53618 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPB1P53618 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPB1P53618 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB1P53618 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB1P53618 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB1P53618 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB1P53618 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms