Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 PRK1YIL095W 2433 nt2.41□□□□□ -2.02
SEF1P34228 SAK1YER129W 3429 nt2.4□□□□□ -2.02
SEF1P34228 TRS130YMR218C 3309 nt2.4□□□□□ -2.03
SEF1P34228 HMRA1YCR097W 381 nt2.4□□□□□ -2.03
SEF1P34228 RPC10YHR143W-A 213 nt2.4□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YKL202WYKL202W 582 nt2.4□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YNL324WYNL324W 396 nt2.4□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YOR248WYOR248W 303 nt2.4□□□□□ -2.03
SEF1P34228 SLM6YBR266C 453 nt2.4□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YKR078WYKR078W 1758 nt2.4□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YPK1YKL126W 2043 nt2.4□□□□□ -2.03
SEF1P34228 RNH70YGR276C 1662 nt2.4□□□□□ -2.03
SEF1P34228 PSD2YGR170W 3417 nt2.4□□□□□ -2.03
SEF1P34228 SGS1YMR190C 4344 nt2.4□□□□□ -2.03
SEF1P34228 FKS3YMR306W 5358 nt2.39□□□□□ -2.03
SEF1P34228 TOR1YJR066W 7413 nt2.39□□□□□ -2.03
SEF1P34228 STE11YLR362W 2154 nt2.39□□□□□ -2.03
SEF1P34228 CBF2YGR140W 2871 nt2.39□□□□□ -2.03
SEF1P34228 SDC1YDR469W 528 nt2.39□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.39□□□□□ -2.03
SEF1P34228 NCE101YJL205C 162 nt2.39□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YKL111CYKL111C 336 nt2.39□□□□□ -2.03
SEF1P34228 SEN15YMR059W 387 nt2.39□□□□□ -2.03
SEF1P34228 SIP18YMR175W 240 nt2.39□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.39□□□□□ -2.03
SEF1P34228 VPS16YPL045W 2397 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 NUM1YDR150W 8247 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YJL181WYJL181W 1836 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 NUP82YJL061W 2142 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YDL068WYDL068W 330 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YFR056CYFR056C 369 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 TWF1YGR080W 999 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 KEL2YGR238C 2649 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YHR125WYHR125W 306 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YIL174WYIL174W 228 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 IGO1YNL157W 507 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 GDS1YOR355W 1569 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YEL043WYEL043W 2871 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 SIR3YLR442C 2937 nt2.38□□□□□ -2.03
SEF1P34228 AXL1YPR122W 3627 nt2.37□□□□□ -2.03
SEF1P34228 CAJ1YER048C 1176 nt2.37□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.37□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YGR042WYGR042W 816 nt2.37□□□□□ -2.03
SEF1P34228 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.37□□□□□ -2.03
SEF1P34228 EMC6YLL014W 327 nt2.37□□□□□ -2.03
SEF1P34228 IRC19YLL033W 693 nt2.37□□□□□ -2.03
SEF1P34228 TEN1YLR010C 483 nt2.37□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YLR269CYLR269C 351 nt2.37□□□□□ -2.03
SEF1P34228 SNU114YKL173W 3027 nt2.37□□□□□ -2.03
SEF1P34228 PPN1YDR452W 2025 nt2.37□□□□□ -2.03
SEF1P34228 EDS1YBR033W 2760 nt2.37□□□□□ -2.03
SEF1P34228 BCK1YJL095W 4437 nt2.37□□□□□ -2.03
SEF1P34228 UBP11YKR098C 2154 nt2.36□□□□□ -2.03
SEF1P34228 REV1YOR346W 2958 nt2.36□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.36□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YKL063CYKL063C 504 nt2.36□□□□□ -2.03
SEF1P34228 RRT1YBL048W 312 nt2.36□□□□□ -2.03
SEF1P34228 LSM7YNL147W 348 nt2.36□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YBR277CYBR277C 402 nt2.36□□□□□ -2.03
SEF1P34228 NAN1YPL126W 2691 nt2.36□□□□□ -2.03
SEF1P34228 NUP100YKL068W 2880 nt2.36□□□□□ -2.03
SEF1P34228 UBP1YDL122W 2430 nt2.36□□□□□ -2.03
SEF1P34228 PTC5YOR090C 1719 nt2.35□□□□□ -2.03
SEF1P34228 Q0142Q0142 177 nt2.35□□□□□ -2.03
SEF1P34228 SHE2YKL130C 741 nt2.35□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YLR101CYLR101C 396 nt2.35□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YMR320WYMR320W 306 nt2.35□□□□□ -2.03
SEF1P34228 PEX17YNL214W 600 nt2.35□□□□□ -2.03
SEF1P34228 ATP3YBR039W 936 nt2.35□□□□□ -2.03
SEF1P34228 PRM3YPL192C 402 nt2.35□□□□□ -2.03
SEF1P34228 ROX1YPR065W 1107 nt2.35□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YJL016WYJL016W 1686 nt2.34□□□□□ -2.03
SEF1P34228 VTC3YPL019C 2508 nt2.34□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.34□□□□□ -2.03
SEF1P34228 BTT1YDR252W 450 nt2.34□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.34□□□□□ -2.03
SEF1P34228 MPH1YIR002C 2982 nt2.34□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YKL066WYKL066W 444 nt2.34□□□□□ -2.03
SEF1P34228 YLR031WYLR031W 561 nt2.34□□□□□ -2.03
SEF1P34228 IPT1YDR072C 1584 nt2.34□□□□□ -2.03
SEF1P34228 SRO77YBL106C 3033 nt2.34□□□□□ -2.03
SEF1P34228 RRP12YPL012W 3687 nt2.34□□□□□ -2.04
SEF1P34228 GIS1YDR096W 2685 nt2.34□□□□□ -2.04
SEF1P34228 NCL1YBL024W 2055 nt2.33□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YEF3YLR249W 3135 nt2.33□□□□□ -2.04
SEF1P34228 RPO41YFL036W 4056 nt2.33□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.33□□□□□ -2.04
SEF1P34228 NBL1YHR199C-A 222 nt2.33□□□□□ -2.04
SEF1P34228 SAS2YMR127C 1017 nt2.33□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.33□□□□□ -2.04
SEF1P34228 CMC2YBL059C-A 330 nt2.33□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YOR050CYOR050C 348 nt2.33□□□□□ -2.04
SEF1P34228 snR13snR13 124 nt2.33□□□□□ -2.04
SEF1P34228 TSC3YBR058C-A 243 nt2.33□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YPR039WYPR039W 336 nt2.33□□□□□ -2.04
SEF1P34228 NUP120YKL057C 3114 nt2.33□□□□□ -2.04
SEF1P34228 PHO2YDL106C 1680 nt2.32□□□□□ -2.04
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