Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms