Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO3A2RU48 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms