Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP4S1Q9Y587 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP4S1Q9Y587 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4S1Q9Y587 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP4S1Q9Y587 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP4S1Q9Y587 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4S1Q9Y587 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4S1Q9Y587 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4S1Q9Y587 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP4S1Q9Y587 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP4S1Q9Y587 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP4S1Q9Y587 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP4S1Q9Y587 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP4S1Q9Y587 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP4S1Q9Y587 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP4S1Q9Y587 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms