Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT52Q9Y366 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT52Q9Y366 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT52Q9Y366 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT52Q9Y366 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT52Q9Y366 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT52Q9Y366 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT52Q9Y366 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT52Q9Y366 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT52Q9Y366 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT52Q9Y366 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT52Q9Y366 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT52Q9Y366 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT52Q9Y366 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT52Q9Y366 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT52Q9Y366 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms