Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3M1Q9Y2T2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3M1Q9Y2T2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M1Q9Y2T2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AP3M1Q9Y2T2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms