Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3BQ9UH17 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3BQ9UH17 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3BQ9UH17 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3BQ9UH17 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3BQ9UH17 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3BQ9UH17 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3BQ9UH17 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC3BQ9UH17 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC3BQ9UH17 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3BQ9UH17 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms