Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCD2Q9UBJ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD2Q9UBJ2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCD2Q9UBJ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCD2Q9UBJ2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms