Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP4Q9P0V3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP4Q9P0V3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4Q9P0V3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4Q9P0V3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms