Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
FBXO28Q9NVF7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FBXO28Q9NVF7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FBXO28Q9NVF7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FBXO28Q9NVF7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FBXO28Q9NVF7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FBXO28Q9NVF7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FBXO28Q9NVF7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FBXO28Q9NVF7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FBXO28Q9NVF7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FBXO28Q9NVF7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
FBXO28Q9NVF7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
FBXO28Q9NVF7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
FBXO28Q9NVF7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
FBXO28Q9NVF7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FBXO28Q9NVF7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FBXO28Q9NVF7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FBXO28Q9NVF7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
FBXO28Q9NVF7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FBXO28Q9NVF7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FBXO28Q9NVF7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FBXO28Q9NVF7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FBXO28Q9NVF7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FBXO28Q9NVF7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FBXO28Q9NVF7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FBXO28Q9NVF7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FBXO28Q9NVF7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FBXO28Q9NVF7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FBXO28Q9NVF7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms