Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TULP4Q9NRJ4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TULP4Q9NRJ4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TULP4Q9NRJ4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TULP4Q9NRJ4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TULP4Q9NRJ4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TULP4Q9NRJ4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TULP4Q9NRJ4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TULP4Q9NRJ4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TULP4Q9NRJ4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TULP4Q9NRJ4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TULP4Q9NRJ4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TULP4Q9NRJ4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TULP4Q9NRJ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
TULP4Q9NRJ4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TULP4Q9NRJ4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TULP4Q9NRJ4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TULP4Q9NRJ4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TULP4Q9NRJ4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TULP4Q9NRJ4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TULP4Q9NRJ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TULP4Q9NRJ4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TULP4Q9NRJ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TULP4Q9NRJ4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TULP4Q9NRJ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TULP4Q9NRJ4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TULP4Q9NRJ4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TULP4Q9NRJ4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TULP4Q9NRJ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TULP4Q9NRJ4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TULP4Q9NRJ4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TULP4Q9NRJ4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TULP4Q9NRJ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TULP4Q9NRJ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TULP4Q9NRJ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TULP4Q9NRJ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TULP4Q9NRJ4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TULP4Q9NRJ4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TULP4Q9NRJ4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TULP4Q9NRJ4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TULP4Q9NRJ4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TULP4Q9NRJ4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TULP4Q9NRJ4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
TULP4Q9NRJ4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TULP4Q9NRJ4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TULP4Q9NRJ4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TULP4Q9NRJ4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TULP4Q9NRJ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TULP4Q9NRJ4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TULP4Q9NRJ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TULP4Q9NRJ4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TULP4Q9NRJ4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TULP4Q9NRJ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TULP4Q9NRJ4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
TULP4Q9NRJ4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TULP4Q9NRJ4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TULP4Q9NRJ4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TULP4Q9NRJ4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TULP4Q9NRJ4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TULP4Q9NRJ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TULP4Q9NRJ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TULP4Q9NRJ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TULP4Q9NRJ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TULP4Q9NRJ4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TULP4Q9NRJ4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms