Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASS4Q9NQ75 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASS4Q9NQ75 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASS4Q9NQ75 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASS4Q9NQ75 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASS4Q9NQ75 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASS4Q9NQ75 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASS4Q9NQ75 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASS4Q9NQ75 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASS4Q9NQ75 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASS4Q9NQ75 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASS4Q9NQ75 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASS4Q9NQ75 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASS4Q9NQ75 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASS4Q9NQ75 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASS4Q9NQ75 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASS4Q9NQ75 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASS4Q9NQ75 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CASS4Q9NQ75 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASS4Q9NQ75 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASS4Q9NQ75 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASS4Q9NQ75 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASS4Q9NQ75 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms