Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4BQ9NPR2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4BQ9NPR2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4BQ9NPR2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4BQ9NPR2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4BQ9NPR2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA4BQ9NPR2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4BQ9NPR2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4BQ9NPR2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4BQ9NPR2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.2 ms