Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEMA6CQ9H3T2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6CQ9H3T2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6CQ9H3T2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6CQ9H3T2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6CQ9H3T2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6CQ9H3T2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6CQ9H3T2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA6CQ9H3T2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA6CQ9H3T2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA6CQ9H3T2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA6CQ9H3T2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA6CQ9H3T2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA6CQ9H3T2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA6CQ9H3T2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms