Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3K2

GHITM, Growth hormone-inducible transmembrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GHITMQ9H3K2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms