Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
XPO4Q9C0E2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
XPO4Q9C0E2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPO4Q9C0E2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPO4Q9C0E2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPO4Q9C0E2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XPO4Q9C0E2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XPO4Q9C0E2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XPO4Q9C0E2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XPO4Q9C0E2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPO4Q9C0E2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPO4Q9C0E2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPO4Q9C0E2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPO4Q9C0E2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
XPO4Q9C0E2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XPO4Q9C0E2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPO4Q9C0E2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XPO4Q9C0E2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
XPO4Q9C0E2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
XPO4Q9C0E2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
XPO4Q9C0E2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XPO4Q9C0E2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XPO4Q9C0E2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
XPO4Q9C0E2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XPO4Q9C0E2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XPO4Q9C0E2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
XPO4Q9C0E2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XPO4Q9C0E2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPO4Q9C0E2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPO4Q9C0E2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms