Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BRINP2Q9C0B6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRINP2Q9C0B6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRINP2Q9C0B6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRINP2Q9C0B6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRINP2Q9C0B6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRINP2Q9C0B6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRINP2Q9C0B6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRINP2Q9C0B6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRINP2Q9C0B6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRINP2Q9C0B6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRINP2Q9C0B6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRINP2Q9C0B6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRINP2Q9C0B6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms