Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms