Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP3-1Q9BYR8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP3-1Q9BYR8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP3-1Q9BYR8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP3-1Q9BYR8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms