Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PCGF6Q9BYE7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
PCGF6Q9BYE7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
PCGF6Q9BYE7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PCGF6Q9BYE7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
PCGF6Q9BYE7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PCGF6Q9BYE7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PCGF6Q9BYE7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PCGF6Q9BYE7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PCGF6Q9BYE7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
PCGF6Q9BYE7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
PCGF6Q9BYE7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
PCGF6Q9BYE7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
PCGF6Q9BYE7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PCGF6Q9BYE7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PCGF6Q9BYE7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PCGF6Q9BYE7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PCGF6Q9BYE7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PCGF6Q9BYE7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
PCGF6Q9BYE7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
PCGF6Q9BYE7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
PCGF6Q9BYE7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PCGF6Q9BYE7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PCGF6Q9BYE7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PCGF6Q9BYE7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PCGF6Q9BYE7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PCGF6Q9BYE7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PCGF6Q9BYE7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
PCGF6Q9BYE7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PCGF6Q9BYE7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PCGF6Q9BYE7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
PCGF6Q9BYE7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
PCGF6Q9BYE7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PCGF6Q9BYE7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PCGF6Q9BYE7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PCGF6Q9BYE7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PCGF6Q9BYE7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PCGF6Q9BYE7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PCGF6Q9BYE7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PCGF6Q9BYE7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PCGF6Q9BYE7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PCGF6Q9BYE7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PCGF6Q9BYE7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PCGF6Q9BYE7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PCGF6Q9BYE7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PCGF6Q9BYE7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
PCGF6Q9BYE7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
PCGF6Q9BYE7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PCGF6Q9BYE7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PCGF6Q9BYE7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PCGF6Q9BYE7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PCGF6Q9BYE7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PCGF6Q9BYE7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PCGF6Q9BYE7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PCGF6Q9BYE7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
PCGF6Q9BYE7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
PCGF6Q9BYE7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PCGF6Q9BYE7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PCGF6Q9BYE7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PCGF6Q9BYE7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PCGF6Q9BYE7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
PCGF6Q9BYE7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PCGF6Q9BYE7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
PCGF6Q9BYE7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
PCGF6Q9BYE7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PCGF6Q9BYE7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PCGF6Q9BYE7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PCGF6Q9BYE7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PCGF6Q9BYE7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
PCGF6Q9BYE7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PCGF6Q9BYE7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PCGF6Q9BYE7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
PCGF6Q9BYE7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
PCGF6Q9BYE7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PCGF6Q9BYE7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PCGF6Q9BYE7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PCGF6Q9BYE7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PCGF6Q9BYE7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PCGF6Q9BYE7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PCGF6Q9BYE7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
PCGF6Q9BYE7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
PCGF6Q9BYE7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PCGF6Q9BYE7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PCGF6Q9BYE7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms