Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf88Q9BSF0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C2orf88Q9BSF0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C2orf88Q9BSF0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms